Saat ini Universitas Mataram mengelola 48 program studi yang terdiri dari 9 program studi Magister, 35 program studi S-1 dan 4 program studi D-3. Khusus untuk Program Studi Magister (S-2) dikelola langsung oleh Program Pascasarjana berdasarkan SK Rektor No.6847/J18.H/HK.01.11/2006  tanggal 3 Juni 2006.